Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SbdsP70122 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SbdsP70122 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms