Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms