Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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