Protein–RNA interactions for Protein: P61922

Abat, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbatP61922 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AbatP61922 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AbatP61922 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms