Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Cldn18P56857 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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