Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CdaP56389 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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CdaP56389 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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CdaP56389 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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CdaP56389 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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CdaP56389 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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CdaP56389 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CdaP56389 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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