Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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