Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms