Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TspoP50637 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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