Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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