Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtshP49935 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtshP49935 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtshP49935 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms