Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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