Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms