Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mmp9P41245 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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