Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbP41155 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbP41155 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbP41155 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbP41155 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbP41155 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbP41155 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms