Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TfamP40630 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TfamP40630 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms