Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtlP38585 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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