Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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