Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms