Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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