Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb9P28076 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms