Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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