Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkchP23298 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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