Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PparaP23204 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PparaP23204 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms