Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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