Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms