Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TP20293 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TP20293 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms