Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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