Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NefhP19246 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NefhP19246 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NefhP19246 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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