Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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P18530 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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P18530 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18530 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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P18530 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18530 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18530 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18530 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18530 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18530 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18530 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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