Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18525 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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P18525 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18525 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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P18525 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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