Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PcnaP17918 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PcnaP17918 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms