Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms