Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RhoP15409 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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RhoP15409 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RhoP15409 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RhoP15409 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RhoP15409 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RhoP15409 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RhoP15409 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RhoP15409 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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