Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DmdP11531 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DmdP11531 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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DmdP11531 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms