Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms