Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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P10404 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P10404 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P10404 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P10404 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P10404 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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P10404 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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P10404 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P10404 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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