Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ifna9P09235 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms