Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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