Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp4O70480 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms