Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ldb2O55203 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb2O55203 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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