Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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