Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms