Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Sp100O35892 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sp100O35892 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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