Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Casq1O09165 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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