Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MttpO08601 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MttpO08601 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MttpO08601 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MttpO08601 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MttpO08601 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MttpO08601 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms