Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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