Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms