Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf4bG5E8Z2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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