Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms